Аналитический центр ЕКГ получает внешнюю финансовую поддержку в виде грантов как от общественных, так и от частных организаций. Аналитический центр принимает финансовую и неденежную поддержку при чётком взаимном понимании того, что Аналитический центр ЕКГ будет в любое время сохранять полную и абсолютную независимость и принимать решения, основываясь исключительно на интересах и потребностях пациентов.
В 2021 году Аналитический центр ЕКГ получил безвозмездные гранты, не предполагающие вмешательства, от компаний Bayer, BioMarin, CSL Behring, Novo Nordisk, Roche, Sanofi, Sobi и Takeda.
